（二）组织人事科
   研究制订卫生人才发展规划，研究人才交流、继续教育相关政策，开发卫生人力资源；负责本行业各级各类专业技术人员的资质认定工作，监督指导医疗卫生机构劳动、人事政策和法规的实施；负责卫生系统人事分配制度改革工作；负责全县卫生系统各项奖惩工作；负责本系统退休职工的管理工作。按干部管理权限，负责局机关、下属单位及归口管理单位的干部培养、选拔、监督和管理；指导基层加强党的建设；总结推广基层党建工作的先进经验；负责下属单位人员的出国（境）政审工作；负责统战、知识分子和台湾事务、侨务等工作；负责受理监察对象的控告和申诉；负责查处监察对象的违纪案件。

   （三）医政科教科
   贯彻执行有关医政法律、法规，制订医疗事业的发展规划、政策和服务标准；依法受理医疗机构执业许可审核工作；负责医疗机构的质量评估和执业管理；负责执业医师、执业护士的注册考核工作；负责医疗机构采供血机构从业人员的准入；负责医疗机构重点专科建设与管理；负责全县医疗、护理、急救、采供血、医院制剂、临床药学、医疗设备等管理；负责医疗广告的初审工作；负责协调处理各种医疗纠纷，承办医疗事故鉴定委员会委托的事务；协助做好重大突发事件、自然灾害的医疗救护；组织协调各类法定体检；协助有关部门开展伤残鉴定、司法鉴定；研究拟定县卫生科技发展、人才培养计划；负责全县卫生科技攻关和科技项目、科技成果的审核管理工作；负责对外合作、学术交流和卫生类学术团体的业务指导工作；贯彻执行国家关于中医药工作和方针、政策，负责拟订并组织实施全县中医事业发展规划。

   （四）卫生监督与疾病控制科
   依据国家有关卫生法律法规，制订实施全县卫生监督计划；依法开展卫生监督层级督查；负责各种现场监测与委托技术检测工作；监督管理全县传染病防治及食品、职业、公共场所、放射和学校卫生，办理医疗机构的执业和健康相关产品的许可证工作。
   拟订健康教育实施计划；拟定传染病、血吸虫病、地方病、慢性非传染性疾病与公共卫生相关疾病的防治计划和措施；负责对人体生命健康相关指标的监控，组织对重大传染病、地方病的综合防治；控制重大疫情的发生流行；组织疫情检测、评估、防治效果；承办县政府血吸虫病、地方病防治领导小组的日常工作；负责制订社区卫生服务发展规划及年度工作计划；指导社区卫生服务中心、社区卫生服务站的业务建设；组织对社区卫生服务工作进行质量评估；拟定初级卫生保健工作的计划和评估标准并组织实施；会同有关部门拟定妇幼卫生工作规划、政策措施和母婴保健服务技术标准，指导全县妇女保健、儿童保健业务；负责农村大病风险、农村合作医疗的日常管理工作。

   （五）规划财务科
   统筹规划与协调全县卫生经济资源配置；编制卫生事业经费的预算、决算，协调落实卫生事业经费；负责本系统重大建设项目的追踪管理和卫生事业费使用管理；拟定卫生财务管理规章并监督实施；研究提出卫生服务价格建议，协同有关部门指导全县医疗卫生收费管理并督促检查；指导县卫生基本建设，监管下属单位国有资产运行和对设备、物资实行政府集中采购；贯彻执行审计法律法规，组织实施系统内财务结算中心工作和监督检查下属单位内部审计、会计委派等工作。
另按有关规定设置纪委、检察室、人武部（合署办公）。